Un equipo internacional de científicos ha creado un nuevo modelo informático que puede utilizarse para predecir la función de genes de plantas no caracterizados con una rapidez y precisión sin precedentes.
Esta red, denominada AraNet, tiene más de 19.600 genes asociados entre sí por más de un millón de enlaces y puede multiplicar por diez la velocidad de descubrimiento de nuevos genes afiliados con un determinado evento.
Se trata de un importantísimo avance para la fitobiología fundamental y la investigación agrícola.
«En esencia, AraNet se basa en el simple concepto de que los genes que residen físicamente en la misma vecindad, o que se activan de forma concertada, están probablemente asociados a eventos similares», explica la autora Sue Rhee, del Departamento de Biología Vegetal del Instituto Carnegie.
«Nosotros lo llamamos culpabilidad por asociación. Aranet se basa en más de 50 millones de observaciones científicas y contiene más de un millón de enlaces de los 19.600 genes que contiene la pequeña planta experimental de la mostaza Arabidopsis thaliana.
Hemos realizado un mapa de estas asociaciones y hemos demostrado que podemos utilizar la red para proponer que los genes no caracterizados están vinculados a eventos concretos basándonos en la fuerza de su asociación con genes que ya sabemos que están vinculados a esas características».
Los científicos probaron la precisión de AraNet con ensayos de validación informatizados y experimentos de laboratorio con genes que la red había determinado como relacionados. Observaron que esta red predice asociaciones correctas con mucho mayor acierto que anteriores redes de genes de Arabidopsis de pequeña escala.