Muchos países latinoamericanos han instituido sus propios programas nacionales de promoción y consumo de biocombustibles, confiando en poder reproducir el éxito del programa brasileño de biocombustibles, tanto a nivel local como a nivel mundial. Colombia, Venezuela, Costa Rica y Guatemala tienen planeado producir etanol biocombustible de caña de azúcar. Argentina se concentra en el biodiésel de soja. La soja y (en cierto modo) la caña de azúcar son cultivos bioenergéticos que son en parte de uso alimentario y, por tanto, pueden plantear problemas de sostenibilidad. La cuestión de la sostenibilidad de los biocombustibles tiene importantes implicaciones de cara al futuro en los países latinoamericanos que producen estos cultivos bioenergéticos.
Están planteándose propuestas para implantar sistemas de certificación (por ejemplo, en algunos países europeos) que garanticen que sólo se puedan comercializar biocombustibles obtenidos por medio de una producción sostenible. Los investigadores de WIP Renewable Energies (Alemania) presentan «una visión general de los principales puntos conflictivos de la producción de biocombustibles latinoamericana» y una evaluación de herramientas e iniciativas destinadas a garantizar una producción sostenible en el continente.
El estudio alcanza, entre otras, las siguientes conclusiones:
(1) la sostenibilidad de la producción de biocombustibles de Latinoamérica está en entredicho debido a impactos negativos como la deforestación de la Amazonia, la degradación del Cerrado, el desplazamiento de las comunidades indígenas y el conflicto entre alimentos y combustibles;
(2) las partes interesadas de la industria y los gobiernos de América Latina han puesto en marcha algunas iniciativas de sostenibilidad con el fin de reducir estos impactos negativos, como la «Moratoria de la Amazonia», la «Iniciativa del etanol sostenible verificado» y la «Mesa redonda sobre una soja responsable».
Aunque muchas de estas iniciativas tienen carácter voluntario, se consideran importantes para mejorar «la sostenibilidad económica, medioambiental y social de la producción y el consumo de biocombustibles en América Latina, y para facilitar las exportaciones al mercado europeo». El informe completo se ha publicado en la revista Energy Policy.