La comparación de secuencias genómicas completas de diferentes organismos para construir sus árboles evolutivos puede ser muy laboriosa y tediosa. Las técnicas que utilizan los científicos comparan pequeños grupos de genes comunes a los organismos objeto de comparación. Sin embargo, estas técnicas podrían no ser aplicables para comparar organismos que tengan un parentesco lejano. Basándose en los métodos de comparación de textos que se utilizan para detectar plagios en programas informáticos, libros y otras publicaciones, un equipo de investigadores de la Universidad de California-Berkeley ha desarrollado una técnica mejorada para comparar secuencias genómicas completas. «Este método trata el genoma como si fuera un libro sin espacios», afirma Sung-Hou Kim, investigador jefe del estudio. Kim señala que la técnica de perfiles de frecuencia de características (FFP) produce agrupaciones de organismos básicamente coherentes con las agrupaciones actuales, pero con algunas discrepancias. Por ejemplo, la posición relativa de los grupos en el árbol familiar es bastante diferente de la que se obtiene con los métodos convencionales de correspondencia de genes. Además de su aplicación en la genómica comparativa, Kim espera que la FFP sea de utilidad para explorar la ascendencia y la demografía de enfermedades del ser humano, además de para agrupar datos metagenómicos.