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Nueva herramienta para la genómica funcional del arroz
18 de enero de 2009
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Científicos de la Universidad de California Davis, encabezados por la fitopatóloga Pamela Ronald, han desarrollado una nueva herramienta para investigar la función genética del arroz. La micromatriz de ADN del arroz, barata y de dominio público, comprende casi todos los 45.000 genes que contiene el genoma del arroz. Los investigadores confían en que su herramienta favorezca el avance de los estudios de genómica funcional del arroz. Los detalles se publican esta semana en la revista de libre acceso PLoS ONE.   Los científicos han desarrollado métodos de altas prestaciones para examinar los perfiles de expresión de genes utilizando «micromatrices de ADN o chips genómicos», miles de fragmentos de ADN adheridos a un portaobjetos de vidrio. Esta tecnología permite a los científicos comprender mejor la interacción simultánea de miles de genes.   Según los investigadores, la mayoría de los estudios sobre el arroz realizados con micromatrices hasta la fecha no se han centrado en el descubrimiento de la función genética en sí misma, sino que han realizado un perfil de un determinado órgano, respuesta ambiental o antecedente genético. Con la matriz NSF45K, Ronald y su equipo han podido identificar genes que realizan importantes procesos bioquímicos relacionados con la luz, como la fotosíntesis y la fotorrespiración.   El grupo también ha desarrollado un programa basado en Internet que permite al usuario comparar perfiles de expresión de genes de varias plataformas de micromatrices de arroz, lo cual acelerará todavía más esta investigación.
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