Los científicos del Departamento de Agricultura de EE.UU. han documentado que varias especies de Aspergillus niger pueden infectar los cultivos de maíz y cacahuete como endófitos.
Los endófitos son hongos que colonizan los tejidos sanos de las plantas, a veces sin mostrar síntomas de infección. Utilizando técnicas moleculares el científico Charles Bacon y sus colegas del Servicio de Investigación Agrícola (ARS) del USDA han descubierto más de 18 especies de Aspergillus niger, varias de las cuales podrían producir sustancias químicas tóxicas denominadas micotoxinas.
También han descubierto que varias especies de A. aspergilli, que se consideraban incapaces de liberar micotoxinas, pueden producir ocratoxinas, micotoxinas carcinógenas para el ser humano, el ganado y las aves. Los resultados de este estudio se han publicado en la revista Toxins.