Un grupo de investigadores de la Universidad del Estado de Dakota del Sur (EE.UU.) y sus colaboradores han realizado los primeros estudios sobre el transcriptoma de la Spartina pectinata Bosc ex Link.
Se considera que este estudio servirá de «base y marco para la expresión y el análisis genómico» en la Spartina pectinata, para su desarrollo como materia prima biocombustible de segunda generación (es decir, lignocelulósica). La Spartina pectinata tiene interés como cultivo bioenergético potencial debido a:
(1) su capacidad para prosperar en tierras marginales inadecuadas para la producción de cultivos convencionales, y
(2) su capacidad para sobrevivir en áridas praderas abiertas.
El análisis del transcriptoma (es decir, la pequeña parte del ADN que se transcribe a las moléculas de ácido ribonucleico o ARN) permitiría a los científicos determinar qué puede hacer una determinada secuencia de ADN.
Los fitomejoradores podrían entonces utilizar la selección asistida por marcadores para incluir de forma deliberada secuencias de genes que confieran determinadas características, como la capacidad de la planta para producir más carbohidratos fermentables para aumentar la producción de etanol o la capacidad de cultivar Spartina pectinata «baja en lignina» para reducir el coste del pretratamiento.
Según los investigadores, «se han identificado varios marcadores moleculares adecuados para elaborar mapas moleculares, identificar genes y realizar estudios de genómica comparativa», y los resultados de su trabajo «se utilizarán conjuntamente con otros estudios realizados para convertir la Spartina pectinata en un cultivo de biomasa celulósica viable». El artículo completo se ha publicado en la revista de acceso libre The Plant Genome.