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La aparente falta de correlación entre el tamaño del genoma de un organismo y su complejidad lleva mucho tiempo desconcertando a los científicos. Organismos simples como algunos hongos y bacterias pueden tener genomas mucho mayores que otros más complicados.    Ha quedado claro que el elemento genético transponible influye en el crecimiento del tamaño del genoma, sobre todo en las plantas. Estudios recientes en maíz y algodón revelan que el tamaño de su genoma ha aumentado de forma significativa durante los últimos millones de años debido a la proliferación de retrotransposones, elementos genéticos móviles capaces de amplificarse en el genoma. Las evidencias indican que la evolución del tamaño del genoma de las plantas tiende a aumentar, aunque debe de haber algún límite para su crecimiento. Las plantas emplean varios mecanismos, como la recombinación homóloga, para eliminar el ADN «basura». No obstante, la cuestión sigue siendo si estos mecanismos realmente influyen de algún modo para reducir el tamaño del genoma.