Se considera que las microalgas oleaginosas tienen potencial como materia prima para la producción de biodiésel. Estos microorganismos suelen cultivarse en grandes estanques y después se recogen para extraer sus aceites (principalmente triglicéridos). Los aceites extraídos se someten entonces a una reacción de «transesterificación» con metanol con el fin de obtener una mezcla de metilésteres (que reciben colectivamente el nombre de «biodiésel»). Para decidir qué microalgas podrían cultivarse con el fin de obtener biodiésel hay que determinar cuánto aceite pueden producir y qué tipos de triglicéridos incorpora el aceite. El método habitual de análisis de los triglicéridos consiste en disgregarlos para obtener los ácidos grasos componentes y a continuación «derivatizar» estos en sus metilésteres correspondientes para inyectarlos en un cromatógrafo de gases. Sin embargo, según los investigadores del Consejo Nacional de Investigación de Canadá, la detección GC (gasocromatográfica) de los metilésteres de ácidos grasos (FAME) en las muestras de aceite «ofrece datos fragmentados de identificación de los ácidos grasos» y no proporciona información alguna sobre los lípidos intactos. En consecuencia, «el análisis GC podría resultar engañoso si se basa exclusivamente en el perfil de ácidos grasos para seleccionar cepas destinadas a la producción de biocombustibles». Se ha intentado un método alternativo para la medición directa de los lípidos intactos por medio de cromatografía de líquidos de ultra-alta presión-espectrometría de masas (UHPLC-MS). El método se probó utilizando seis tipos diferentes de cepas de algas de posible uso en la producción de biocombustibles: Botryococcus braunii, Nannochloropsis gaditana, Neochloris oleoabundans, Phaeodactyl umtricornutum, Porphyridium aerugineum y Scenedesmus obliquus. El estudio presenta, entre otras, las siguientes conclusiones: (1) este procedimiento ha permitido identificar más de 100 triglicéridos únicos de las seis cepas de algas, (2) «los perfiles [de triglicéridos] más completos», que presentan gran abundancia de ácido oleico, fueron los de Botryococcus braunii y Scenedesmus obliquus. El estudio completo se ha publicado en la revista Analytical and Bioanalytical Chemistry.